Location: A review of cardiac cellular electrophysiology models @ 1e62f9a11a1b / tutorial / csim-reference-description / named_2108.xml

Author:
David Nickerson <nickerso@users.sourceforge.net>
Date:
2011-06-21 15:56:12+12:00
Desc:
adding a standalone version of the SED-ML document for this example, updating to pass validation using Frank's new web tools
Permanent Source URI:
https://models.physiomeproject.org/workspace/a1/rawfile/1e62f9a11a1b467aff7bc1ddd0b4fc8ac3f052c0/tutorial/csim-reference-description/named_2108.xml

<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en"><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mfrac><mml:mrow><mml:mo>d</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2253','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>d</mml:mo><mml:mi><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2123','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">time</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mi></mml:mrow></mml:mfrac><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2469','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">Xr2_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2253','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2470','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">tau_Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2469','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">Xr2_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>88.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>24.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2472','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">alpha_Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>3.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-60.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>20.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2473','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">beta_Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.12</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>60.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>20.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2470','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">tau_Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mscu</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2472','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">alpha_Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2473','named_2108');"><mml:mi mathvariant="normal">beta_Xr2</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math></html>