Model Mathematics

Component: environment

Component: Arg

ddtime Arg = k_1 Fe3_Arg + k_4 Fe2_Arg + S - k1 Arg Fe3 + k4 Arg Fe2 S = k1 Arg Fe3 + k4 Arg Fe2 - k_1 Fe3_Arg + k_4 Fe2_Arg

Component: Fe3

ddtime Fe3 = k_1 Fe3_Arg + k14 Fe3_NO + k13 Fe2_NO O2 + k8 Fe3_NOHA - k1 Arg Fe3 + k2 Fe3 + k_8 NOHA Fe3

Component: Fe3_Arg

ddtime Fe3_Arg = k1 Fe3 Arg - k_1 Fe3_Arg + k3 Fe3_Arg

Component: Fe2

ddtime Fe2 = k2 Fe3 + k_4 Fe2_Arg + k9 Fe2_NOHA - k4 Fe2 Arg + k_9 Fe2 NOHA

Component: Fe2_Arg

ddtime Fe2_Arg = k3 Fe3_Arg + k_5 Fe3_O2_Arg + k4 Fe2 Arg - k5 Fe2_Arg O2 + k_4 Fe2_Arg

Component: Fe3_O2_Arg

ddtime Fe3_O2_Arg = k5 Fe2_Arg O2 - k6 Fe3_O2_Arg + k_5 Fe3_O2_Arg

Component: Fe3_NOHA

ddtime Fe3_NOHA = k6 Fe3_O2_Arg + k_8 Fe3 NOHA - k7 Fe3_NOHA + k8 Fe3_NOHA

Component: Fe2_NOHA

ddtime Fe2_NOHA = k7 Fe3_NOHA + k_10 Fe3_O2_NOHA + k_9 Fe2 NOHA - k9 Fe2_NOHA + k10 Fe2_NOHA O2

Component: Fe3_O2_NOHA

ddtime Fe3_O2_NOHA = k10 Fe2_NOHA O2 - k11 Fe3_O2_NOHA + k_10 Fe3_O2_NOHA

Component: Fe3_NO

ddtime Fe3_NO = k11 Fe3_O2_NOHA - k14 Fe3_NO + k12 Fe3_NO

Component: Fe2_NO

ddtime Fe2_NO = k12 Fe3_NO - k13 Fe2_NO O2

Component: NO

ddtime NO = k14 Fe3_NO dNOdt=k14Fe3_NO

Component: citrulline

ddtime citrulline = k11 Fe3_O2_NOHA

Component: NO3

ddtime NO3 = k13 Fe2_NO O2

Component: NOHA

ddtime NOHA = k8 Fe3_NOHA + k9 Fe2_NOHA - k_8 Fe3 NOHA + k_9 Fe2 NOHA

Component: model_constants